综合办公室：负责研究所日常行政事务管理工作。包括收、发文及印章管理，档案管理，信息化管理，信息宣传，科学传播，所史馆管理，公共安全管理，保密工作，公务车辆管理，医务室和计划生育工作管理，办公用房及会议室管理，物业管理，院士后勤服务等。
主 任：刘红辉
副主任：方琢玉
科研处：负责研究所科研规划，项目申请、项目预算（含国际合作，院地合作，科研装备、仪器修购等）管理，课题管理（含国际合作，院地合作，科研装备、仪器修购等），科研绩效统计，成果奖励，重点实验室管理工作等。
处 长：王绍强
副处长：廖晓勇 韩瑛
人事处：负责研究所在编职工、项目聘用和高访客座人员、博士后、离退休职工日常人事管理工作，以及人才引进、职称评聘和离退休干部管理工作等。
处 长：张宪洲
副处长：姜亚东
财务处：负责研究所财务规划，财务管理（含预决算），财务审计，住房公积金管理，工资发放管理，日常财务工作（借款、报销）等。
副处长：何文华（主持工作）
副处长：刘晓蕊
研究生部：负责研究生（含外籍和港澳台）招生、教育、培养和管理，导师队伍建设，学科培养点建设工作等。
主 任：陈力
副主任：王捷
对外合作处：负责研究所国际合作规划，国际合作项目申请，挂靠国际合作机构管理，外事管理，院地合作，成果转移转化管理工作等。
处 长：邓祥征
副处长：张明
基建与资产处：负责研究所科研基础设施建设和维护（含野外台站），科研装备和仪器购置，职工公费医疗，昌黎休养所管理，以及研究所各类资产（含所办企业）管理和维护工作等。
副处长：占车生（主持工作）
副处长：于伯华
党委办公室：负责研究所党委、纪委、工会（职代会）、妇委会、团委的日常事务管理工作，以及党建、创新文化建设，统战，群众活动组织和管理等。
主 任：刘红辉（兼）
副主任：艾树
